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中国科学院上海药物研究所细菌单细胞转录组测序分析采购项目中标公告
发布时间:2024-09-22 05:41:13        浏览次数:4        返回列表
公告概要:
公告信息:
采购项目名称中国科学院上海药物研究所细菌单细胞转录组测序分析采购项目
品目

服务/专业技术服务/其他专业技术服务

采购单位中国科学院上海药物研究所
行政区域上海市公告时间2023年12月15日 16:40
评审专家名单蔡玉川 杨莉萍 闫红霞 李哲峰 刘红椿(用户代表)
总中标金额¥399.000000 万元(人民币)
联系人及联系方式:
项目联系人杨帆 陈小舫 赵倩
项目联系电话13262733317/021-64318161/010-68290511
采购单位中国科学院上海药物研究所
采购单位地址上海市浦东张江祖冲之路555号
采购单位联系方式崔海音,021-50806092
代理机构名称东方国际招标有限责任公司
代理机构地址北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层
代理机构联系方式杨帆 陈小舫 赵倩,13262733317/021-64318161/010-68290511
附件:
附件1_-2466.rar

一、项目编号:OITC-G230302466(招标文件编号:OITC-G230302466)

二、项目名称:中国科学院上海药物研究所细菌单细胞转录组测序分析采购项目

三、中标(成交)信息

供应商名称:杭州跃真生物科技有限公司

供应商地址:浙江省杭州市余杭区仓前街道余杭塘路2626号2幢201室

中标(成交)金额:399.0000000(万元)

四、主要标的信息

序号    供应商名称      服务名称      服务范围      服务要求      服务时间      服务标准  
1    杭州跃真生物科技有限公司      细菌单细胞转录组测序分析      对细菌样本进行微生物组细菌单细胞转录组测序及分析,可检测细菌样本类型为冻存或福尔马林固定样本。      1.1.*每次可检测样本量不低于4个。
1.2.*投标方内部有规范的质控和 SOP 要求。
1.3.微生物组样本进行细菌单细胞悬液制备,每个样本获得满足实验要求的细菌数量不少于10,000,000个,且制备的悬液中细菌结团率 < 10%,无明显杂质。
1.4.从悬液制备到文库构建完成不超过48小时。
1.5.文库浓度不低于2ng/μl(不少于20μl)。
1.6.文库片段大小符合二代测序要求,即主要片段分布于300bp-700pb。
1.7.文库制备成功率大于70%(计算方法:文库制备成功数/细菌单细胞悬液镜检合格数 X 100%)。
1.8.细菌单细胞进行barcode标记时间小于15分钟,上机成功率>75%。
1.9.cDNA的总体片段大小在100 bp-1000 bp之间,不低于100 bp,且100-200 bp 片段占比低于20%。
1.10.测序质控要求:Q30>85%、有效barcode比例>80%、基因组比对率>70%。
1.11.捕获细菌数1000-20000,中位基因数(以150G,5000个细菌为例)>70个/细胞。
1.12.#可利用微生物组细菌单细胞转录组数据进行物种注释,完成物种鉴定(至“种”水平)。
1.13.#可完成微生物组细菌单细胞转录组基因表达矩阵分析以及UMAP分析。
1.14.#可利用微生物组细菌单细胞转录组数据进行至少3种以上优势菌群的信号通路分析。
1.15.#可利用微生物组细菌单细胞转录组数据进行对应的噬菌体分析。  
   合同签订之日起,30个工作日内      合同签订之日起,每批次送样少于16个样本,在30个工作日内完成测试及后续分析  
             

五、评审专家(单一来源采购人员)名单:

蔡玉川 杨莉萍 闫红霞 李哲峰 刘红椿(用户代表)

六、代理服务收费标准及金额:

本项目代理费收费标准:1980号文

本项目代理费总金额:0.000000 万元(人民币)

七、公告期限

自本公告发布之日起1个工作日。

八、其它补充事宜

附件:招标文件

九、凡对本次公告内容提出询问,请按以下方式联系。

1.采购人信息

名 称:中国科学院上海药物研究所     

地址:上海市浦东张江祖冲之路555号        

联系方式:崔海音,021-50806092      

2.采购代理机构信息

名 称:东方国际招标有限责任公司            

地 址:北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层            

联系方式:杨帆 陈小舫 赵倩,13262733317/021-64318161/010-68290511            

3.项目联系方式

项目联系人:杨帆 陈小舫 赵倩

电 话:  13262733317/021-64318161/010-68290511